目的：建立檀香挥发油的指纹图谱分析方法，为檀香药材的质量评价提供方法与依据。方法：采用乙醚冷浸法提取檀香挥发油，应用GC-MS联用技术，采用HP-5弹性石英毛细管柱（30 m×0.32 mm，0.25 μm），程序升温（柱温90℃，以5℃·min^-1升至160℃，再以0.5℃·min^-1升至165℃，然后再以l℃·min^-1升至180℃，最后10℃·min^-1升至230℃），建立挥发油的共有峰指纹图谱，采用中南大学指纹图谱相似度评价软件和SPSS 20.0软件对不同来源的檀香油对照品及14批样品挥发油分别进行相似度评价和聚类分析。结果：所建立的檀香挥发油GC-MS指纹图谱有较好的重复性、精密度和稳定性（RSD均小于5%）。檀香油对照品及14批样品挥发油中α-檀香醇、β-檀香醇相对百分含量分别为34.225%~51.156%、20.897%~26.857%。以檀香油对照品为参照，14批样品挥发油相关系数为0.622~0.984，相合系数为0.628~0.984，但同一基地采集的5批檀香样品挥发油相关系数为0.924~0.984，相合系数为0.934~0.984，市购檀香样品挥发油相关系数为0.622~0.868，相合系数为0.628~0.838。通过聚类分析，在类间距离=15时，檀香油对照品及14批样品可以分为两类，檀香油对照品及S2~S9号样品为一类，S10~S15号样品为一类。结论：所建立的檀香挥发油GC-MS指纹图谱法为中药檀香的质量控制提供了一种有效手段。同一种植基地檀香样品的指纹图谱相似度较高，质量较均一；市售檀香样品的指纹图谱相似度较低，质量参差不齐。