目的：通过主成分分析（PCA）和判别分析（DA），探讨马鹿茸及梅花鹿茸的相似性和差异性。方法：采用高效液相色谱法测定17个氨基酸、核苷组分、磷脂组分、胆固醇及多胺的含量；采用紫外分光光度法测定水溶性蛋白质及总磷脂含量，以测定的营养成分含量作为主成分分析和判别分析法的分析数据源进行统计分析，化学指标数据采用Excel 2007处理，数据含量差异较大，分析前先将原始数据进行标准化处理。结果：以氨基酸含量为变量，进行主成分分析和判别分析，第1~2主成分得分图显示马鹿茸和梅花鹿茸交叉分布，而判别分析区分马鹿茸和梅花鹿茸正确率为94.8%；以总氨基酸、必需氨基酸、水溶性蛋白等八大营养成分为变量，进行主成分分析和判别分析，第1~2主成分得分图显示梅花鹿茸和马鹿茸明显分为2组，但不同规格的鹿茸交叉分布，而判别分析对梅花鹿茸和马鹿茸正确率仅为81.6%。结论：根据变量指标的不同，应用主成分分析和判别分析统计分析法能够分析不同品种鹿茸的相似性和差异性，为鹿茸的开发和应用提供了重要的理论依据。