目的:分析人参属3种植物的亲缘关系及其可用于鉴别的特异性DNA片段。方法:采用随机扩增多态性DNA分子标记技术(RAPD)对人参属3种药材的基因组DNA进行多态性分析,筛选特异性片段并进行切胶回收、克隆及测序。结果:从120条随机引物中筛选出12条随机引物用于聚合酶链式反应(PCR)扩增,共扩增出111条扩增片段,其中多态性位点107,多态性百分率为96.40%;从聚类分析图可以看出:人参与西洋参的种间亲缘关系最近,聚为一类,而三七相对其他2种较远,单独聚为一类;将筛选出的显性标记的特异性片段进行切胶回收、克隆并测序获得其DNA序列。结论:aRAPD标记技术从分子水平提示了人参属3种植物的亲缘关系,并为后期的特异性鉴别提供基础。根据序列设计用于鉴别人参、西洋参、三七的特异性PCR引物,实现从理论研究向药材鉴别实际运用的转变。