目的： 基于DNA条形码技术及高分辨率熔解曲线（HRM）方法鉴定肉苁蓉药材的基原。方法： 通过聚合酶链式反应（PCR）对肉苁蓉样品的ITS2序列进行扩增；将待鉴定肉苁蓉样品的ITS2序列与Genbank数据库进行BLAST比对；利用MEGA 6.06软件通过建树法进行NJ树聚类分析；通过HRM方法快速鉴定肉苁蓉药材基原。结果： 21份待鉴定肉苁蓉样品ITS2序列的BLAST比对结果中，11份样品与沙苁蓉高度一致，其余10份样品与《中华人民共和国药典》2015年版一部收载品种肉苁蓉（Cistanche deserticola）或管花肉苁蓉（Cistanchetubulosa）高度一致；通过ITS2序列的NJ聚类分析，将21份待鉴定肉苁蓉样品分别聚类到沙苁蓉、管花肉苁蓉、盐生肉苁蓉、肉苁蓉4个种；通过HRM方法鉴定肉苁蓉药材样品，鉴定结果与NJ聚类分析结果一致。结论： 通过DNA条形码和HRM技术均能有效鉴定不同种的肉苁蓉药材样品，且结果一致，起到互相验证的作用，为肉苁蓉及其他中药民族药品种的快速鉴定提供了参考依据。