目的：为了全面了解海龙的蛋白质成分，对其蛋白表达谱进行蛋白质组学分析。方法：应用三氯乙酸/丙酮沉淀法提取海马药材的蛋白质，经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离分析，将聚丙烯酰胺凝胶电泳条带切下进行胶内酶解处理后，应用纳升级反相液相色谱串联质谱（nanoRPLC-MS/MS）法系统分析海马提取蛋白质胶内酶解产物，并进行数据库检索鉴定蛋白质。结果：共鉴定到海马蛋白192种，等电点范围为4.06~12.18，相对分子质量范围为3.06×10³~3.52×10⁶，多肽10 680个；通过生物信息学方法分析了海马提取蛋白质的分子功能。得到海马提取物中的蛋白质具有结合、酶催化、肌动、ATP酶等功能活性，其中结合活性的蛋白质占的比例较大。结论：本研究建立了海马的蛋白质表达谱，可为海马药材中蛋白质的深入研究奠定基础，对海马药材有效成分的分析和海马药材鉴别具有重要意义。